为了插入 SMILES,我们使用了 String Widget 节点。在图 4 中,我们添加了一个 吩噻嗪。
让我们选择一个 多巴胺拮抗剂 作为作用。这经常用于治疗精神分裂症、躁郁症的抗精神病药物或精神病兴奋剂。
图 “输入搜索选项”组件包含两个选项,用于输入子结构搜索和化合物搜索;在本体中分配了特定的角色。
这里有个小提示:作为 字符串小部件,一个 分子字符串输入 节点也可以使用。这样您就可以绘制化学结构,而不是粘贴 SMILES 字符串。
在以下视图(示例工作流中的“结果 开曼群岛电话号码数据 视图”组件)中,您可以检查子结构搜索的结果。此处 平铺视图 和 RDKit 突出显示 用于显示与输入的搜索选项匹配的所有化合物。所有这些化合物都是上一个视图中选择的多巴胺能拮抗剂。
在这个例子中,我们选择了一种名为 丙嗪 查看更多信息。
图 :使用 Tile View 节点显示具有突出显示子结构的化合物的结果视图。
步骤 显示包含类别信息的网络
在此示例工作流程中,我们还想展示一种将本体可视化为网络的方法。我们使用 网络挖矿扩展。此步骤中的视图也是交互式的,这意味着每当选择网络中的一个节点时,网络下的表都会显示所提取实体的更多信息,例如定义。
图 网络视图显示所选化合物以及包含“具有角色”和“是”等 subClassOf 连接的网络。此外,还可以选择更多信息(例如定义和同义词)并将其显示在网络中的节点上。
如果向下滚动,第二个网络将可见。此网络包含从所选化合物(此处为 Promazine)开始的实体,并显示其在 ChEBI 中的分类方式。它显示从化合物到 化学实体的所有“是”链接。此外, 还添加了“具有角色”链接,以在此处显示哪些角色是链接的(蓝色节点)。